全日本選手権全日程終了後、日本卓球協会の臨時理事会の承認を経て、『2016世界選手権クアラルンプール大会(団体戦)』(2月28日〜3月6日・マレーシア)の日本代表選手(男女各5名)が発表された。
【男子日本代表】※WR=世界ランキング(1月)
水谷隼(beacon.LAB)WR6
丹羽孝希(明治大)WR13
吉村真晴(愛知工業大)WR21
松平健太(JTB)WR26
大島祐哉(早稲田大)WR18
【女子日本代表】
福原愛(ANA)WR4
石川佳純(全農)WR7
伊藤美誠(スターツSC)WR12
浜本由惟(JOCエリートアカデミー/大原学園)WR48
若宮三紗子(日本生命)WR24
日本代表選手については、全日本選手権前に、すでにオリンピック日本代表内定者と国内選考会優勝者の男女4名ずつが決まっていた。5人目については、全日本選手権優勝者が選考基準になっていたが、代表に内定していた水谷と石川が優勝したため、強化本部推薦選手として、男子は大島祐哉(早稲田大)、女子は若宮三紗子(日本生命)が選出された。